Agarozės geliai naudojami su DNR dėl didesnio biomolekulių dydžio (DNR fragmentai dažnai yra tūkstančiai kDa). B altyminiams geliams poliakrilamidas suteikia gerą skiriamąją gebą, nes daug mažesnis dydis (tipiškas 50 kDa) labiau tinka siauresniems tarpmolekuliniams gelio tarpams.
Kuo skiriasi agarozės gelio elektroforezė ir poliakrilamido gelio elektroforezė?
Pagrindinis skirtumas tarp agarozės ir poliakrilamido yra tas, kad agarozė naudojama agarozės gelio elektroforezėje (AGE) daugiausia DNR atskyrimui, o poliakrilamidas naudojamas poliakrilamido gelyje. elektroforezė (PAGE) daugiausia skirta b altymams atskirti.
Kodėl poliakrilamido geliai yra geresni už agarozės gelį?
Poliakrilamido geliai, palyginti su agarozės geliais, turi šiuos tris pagrindinius pranašumus: (1) Jų skiriamoji geba yra tokia didelė, kad gali atskirti DNR molekules, kurių ilgis skiriasi tik 0,1 % (t. y. 1 bp iš 1000 bp).). (2) Jie gali talpinti daug didesnį DNR kiekį nei agarozės geliai.
Kodėl apibūdinant b altymus vietoj agarozės naudojamas poliakrilamidas?
Poliakrilamidas ir agarozė yra dvi pagalbinės matricos, dažniausiai naudojamos elektroforezėje. …Agarozė turi didelį porų dydį ir tinka nukleino rūgštims ir dideliems b altymų kompleksams atskirti. Poliakrilamido poros yra mažesnės ir puikiai tinkaatskiriant daugumą b altymų ir mažesnių nukleino rūgščių.
Kodėl naudojamas poliakrilamido gelis?
Poliakrilamido gelio elektroforezė (PAGE) įprastai naudojama b altymų analizei, taip pat gali būti naudojama atskirti mažesnius nei 100 bp nukleorūgščių fragmentus. Nukleino rūgštys paprastai analizuojamos naudojant nepertraukiamą buferio sistemą, kurioje yra pastovi buferio sudėtis, pH ir porų dydis visame gelyje.
