DNR yra neigiamai įkrauta, todėl, kai į gelį patenka elektros srovė, DNR migruos link teigiamai įkrauto elektrodo. Trumpesnės DNR gijos greičiau juda per gelį nei ilgesnės, todėl fragmentai išsidėsto pagal dydį.
Kokie fragmentai juda greičiausiai?
Kadangi visų DNR fragmentų masės krūvis yra vienodas, maži fragmentai gelyje juda greičiau nei dideli.
Kodėl trumpesnės DNR grandinės juda greičiau?
Trumpesni DNR segmentai suranda daugiau porų, pro kurias gali prasiskverbti, ilgesni DNR segmentai turi labiau suspausti ir judėti aukštyn arba žemyn. Dėl šios priežasties trumpesni DNR segmentai juda savo juosta greičiau nei ilgesni DNR segmentai.
Kodėl trumpesni DNR fragmentai nukeliauja toliausiai?
[1] Nukleino rūgščių molekulės atskiriamos naudojant elektrinį lauką, kad neigiamai įkrautos molekulės perkeliamos per agarozės matricą. Trumpesnės molekulės juda greičiau ir migruoja toliau nei ilgesnės nes trumpesnės molekulės lengviau migruoja per gelio poras.
Kodėl superspiralinė DNR veikia greičiau?
In vivo plazmidinė DNR yra glaudžiai susisukęs ratas, kad ji tilptų ląstelės viduje. … Todėl esant tokiam pačiam bendram dydžiui, superspiralinė DNR veikia greičiau nei atviroji DNR. Linijinė DNR pirmiausia praeina per gelio galą ir todėl išlaiko mažesnę trintį nei atviraapskrita DNR, bet daugiau nei superspiralė.