Priešingai, dauguma eukariotų DNR ligazių kartu su archeologiniais ir bakteriofagų fermentais patenka į antrąjį pošeimį; šie fermentai panaudoja ATP kaip kofaktorių.
Ar ligazėms reikalingas ATP?
Paprastai naudojamos dvi DNR ligazės. … T4 ligazei reikalingas ATP , o E. coli ligazei reikalingas NAD+ (nikotinamido adenino dinukleotidas yra kofermentas, susidedantis iš 2 nt, susijungusių per fosfatų grupes). Abu katalizuoja 5'-fosfato ir 3'-OH grupių sujungimą, kad susidarytų fosfodiesterio jungtis.
Kodėl ligazėms reikia ATP?
Du DNR surišimo reakcijos etapai
Pati DNR surišimo reakcija susideda iš dviejų pagrindinių etapų. Pirma, DNR galai turi atsitiktinai susidurti ir likti kartu pakankamai ilgai, kad ligazė susijungtų. … Kad fermentas galėtų vykdyti tolesnes reakcijas, AMP aktyvioje fermento vietoje turi būti papildytas ATP.
Kokią funkciją atlieka ligazės?
DNR ligazės vaidina esminį vaidmenį išlaikant genomo vientisumą, sujungdamos DNR fosfodiesterio pagrindo plyšius, atsirandančius replikacijos ir rekombinacijos metu ir dėl DNR pažeidimo bei jo remontas. Trys žmogaus genai, LIG1, LIG3 ir LIG4, koduoja nuo ATP priklausomas DNR ligazes.
Kas yra ligazės, jos veikia aktyviai ar pasyviai?
DNR ligazė yra aktyvi DNR replikacijos, taisymo ir rekombinacijos proceso metu. Jis plačiai taikomas taisant vienos gijos remontąpažeidžia gyvų organizmų dvipusę DNR, naudojant kaip šabloną papildomą dvigubos spiralės grandinę, o kai kurios formos gali specialiai ištaisyti dvigubos grandinės pažeidimus.
