BLAST gali būti naudojamas keliems tikslams. Tai apima rūšių identifikavimą, domenų nustatymą, filogenijos nustatymą, DNR kartografavimą ir palyginimą. Naudodami BLAST galite teisingai identifikuoti rūšį arba rasti homologines rūšis.
Kam naudojami BLAST?
BLAST yra kompiuterinis algoritmas, kurį galima naudoti internetu Nacionalinio biotechnologijų informacijos centro (NCBI) svetainėje ir daugelyje kitų svetainių. BLAST gali greitai suderinti ir palyginti užklausos DNR seką su sekų duomenų baze, todėl tai yra svarbi priemonė atliekamiems genominiams tyrimams.
Kas yra BLAST technika?
BLAST metodas yra skundų sprendimo metodas, kurį sukūrė Albertas Barneto . Mnemoninis žodis reiškia tikėti, klausyti, atsiprašyti, patenkinti ir padėkoti (1 lentelė). 6. Šiame straipsnyje aprašomas jo naudingumas gydant pacientus ir kaip klinikinė mokymo priemonė.
Kaip BLAST veikia DNR?
Kaip veikia BLAST? BLAST identifikuoja homologines sekas, naudodamas euristinį metodą, kuris iš pradžių randa trumpus atitikmenis tarp dviejų sekų; taigi metodas neatsižvelgia į visą sekos erdvę. Po pradinės atitikties BLAST bando pradėti vietinį lygiavimą nuo šių pradinių atitikčių.
Kodėl BLAST greitesnis už Fasta?
Kalbant apie algoritmo vykdymo sudėtingumą, BLAST yra greitesnis nei FASTA ieškodamas tik reikšmingesnių šablonųsekos. BLAST ir FASTA jautrumas (arba tikslumas) paprastai skiriasi nukleorūgščių ir b altymų sekoms (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
